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客户采用链霉亲和素磁珠捕获DNA探索DNA主动去甲基化新途径——论文通讯

来源:生物磁珠专家 2020-7-18 10:03:39      点击:

武汉大学和北京大学国家重点实验室采用链霉亲和素磁珠捕获DNA探索DNA主动去甲基化新途径。

摘要:可以通过十一个11易位(TET)双加氧酶介导的5mC氧化为5-羟甲基胞嘧啶(5hmC),5-甲酰基胞嘧啶(5fC)和5-羧基胞嘧啶(5caC)来实现5-甲基胞嘧啶(5mC)的主动去甲基化由胸腺嘧啶DNA糖基化酶(TDG)启动的碱基切除修复(BER)。 TDG-BER途径可能导致DNA链断裂的产生,从而可能损害基因组完整性。另外,TET产生的5caC的直接脱羧具有很高的吸引力,因为这种机制允许5mC转化为胞嘧啶而不会形成DNA链断裂。然而,人类细胞中5caC中C–C键的裂解仍是一个悬而未决的问题。我们使用携带5caC的发夹DNA底物在细胞提取物和活细胞中检查了该反应。与全细胞蛋白质提取物一起温育或转染到人类细胞中后,我们使用液相色谱-串联质谱(LC-MS / MS)分析在单核苷酸和寡脱氧核苷酸水平上通过直接脱羧或BER监测了5caC向胞嘧啶的转化。我们的结果清楚地表明,人类细胞中5caC可以直接转化为胞嘧啶,为支持DNA主动去甲基化的新途径提供了证据。

https://www.chinesechemsoc.org/doi/full/10.31635/ccschem.020.202000286


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